Echo在体积小得多的情况下工作的能力也很重要,它在降低酶的成本的同时,大大延长了我们从DNA部件库中获得的使用量。

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伦敦DNA铸造厂自动化主管

未来工厂使用Labcyte自动化扩大合成基因构建

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未来的工厂将使用生命的基石来创建微型基因结构的支架和基础,以支持大规模、高价值的化学、生物和制药制造。像它们的工业前辈一样,这些操作的成功将基于自动化。

伦敦DNA铸造,隶属于伦敦帝国理工学院SynbiCITELabcyte Echo液体处理及其自动访问系统是合成生物学建设中心的重要组成部分。

伦敦DNA铸造厂的合成生物学

“合成生物学和代谢工程等领域越来越多地使用DNA部件的标准化构件,”伦敦DNA铸造厂(London DNA Foundry)自动化部门负责人戴维·麦克里蒙特(David McClymont)说。“生物材料工厂极大地扩大了DNA构建的规模和范围,其核心是像Labcyte Echo这样的自动化工具。”

DNA可以通过多种方式转化;它可以被切割,粘在一起,复制,变异,然后通过微生物转移到生物体中大肠杆菌或酵母。由此产生的DNA结构可以在液体培养中进行筛选和继代培养。

McClymont说,这个过程涉及大量的液体转移,由于即使在一口井中也有大量的部件组合,转移的数量可能会堆积起来。他补充说,不需要处理吸管头是很重要的,可以减少更换吸管时一些材料蒸发的风险。

麦克里蒙特说:“Echo 525和550在体积小得多的情况下工作的能力也很重要,它在降低酶的成本的同时,大大延长了我们从DNA部件库中获得的使用量。”

麦克里蒙特对Labcyte系统并不陌生,他曾在挪威奥斯陆的化学生物学平台担任总工程师,在那里他将这些系统用于传统的化合物库、高通量筛选和分析开发中的化学物质。在Foundry,他正在使用他的两个Echo系统来组合和转移DNA部件,而不是化合物。

伦敦DNA铸造

图片由伦敦DNA铸造

出版:利用并行软件和计算机辅助基因设计的酿酒酵母快速原型平台Workcell平台开发

我们必须重组化合物管理液体处理基础设施,以与DNA一起工作,并解决了许多挑战,使其无缝工作。

Echo仪器及其集成的机器人访问自动化系统是一个更大系统的一部分,该系统包括用于设计实验的实验设计和分析软件JMP,以及一个名为AMOS的定制软件系统,该软件系统与机器人交互,并准备检索数据进行分析和建模。

DNA铸造的用户,其中包括研究人员在学术界和产业界,不仅得益于访问这些尖端设备,但也从一个经验丰富的员工的高通量实验室专家、分子生物学家和软件开发人员能够提供定制的解决方案实验需要的数组。

麦克里蒙特说,特别是扩大新的生物技术应用可能会面临独特的挑战。其中一个挑战是创建一种方法来对酵母兼容设计的构建进行抽象和自动化这篇论文.但他表示,这绝对是值得的。

我们创造了新的能力,这在其他情况下是无法实现的,这使得科学家们能够设计他们以前从未梦想过的实验。

演讲视频

与大卫·麦克里蒙特博士合作的合成生物学设计建造乐动赛事

大卫·麦克乐动赛事里蒙特医生

乐动赛事David McClymont博士,伦敦DNA铸造厂自动化主管,在他的合成生物学研究中讨论了非接触声学液体处理的影响。