回声液体处理

微生物组

缩小您的样品和工作流程20x

微型化显著减少了微生物组研究的时间和成本

人体微生物组在机体免疫反应和代谢稳态中起着至关重要的作用。随着研究人员继续探索和研究身体和微生物组的相互作用,Echo acoustic液体处理通过显著简化图书馆准备工作流程和减少所需样本量而领先。这最终减少了实验室时间和样品成本,显著影响了底线。乐动游戏客户端

    主要好处

  • 通过高效分析小型化降低运营成本
  • 提高了数据质量,分析量低至250 nL
  • 消除交叉污染以获得准确的物种ID
  • 为基因组分析量身定制的集成系统和软件

网络研讨会

低成本、小型化的下一代微生物组和宏基因组测序

Jefferson Lai和Nur A Hasan博士|Labcyte公司和CosmosID

在本演示中,演讲者展示了使用Labcyte Echo 525声学液体处理器和CosmosID的微生物组生物信息学平台,使用16S rRNA扩增子和Nextera XT全基因组的小型化和时效性文库制备,试剂消耗和相关成本降低了10倍。他们证明,微型化反应可以产生足够的读数和高质量的数据,同时通常使用标准协议中描述的体积的十分之一。


有特色的播客

我们需要一个用于宏基因组学的谷歌地图

我们需要一个用于宏基因组学的谷歌地图

在Mendelspod播客上,你可以听到对Labcyte客户Rob Knight博士的采访,了解微生物组学的进展。奈特博士是加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心的教授和创始人,他以其微生物组研究而闻名,包括表明瘦老鼠的微生物组不同于肥胖老鼠的工作。

听播客
Echo 525液体处理器
回声525液体处理机

简化16S和NGS工作流程,以获得更准确的物种ID

对于许多微生物研究来说,样品制备的成本是一个限制因素。Echo液体处理器提供了信心十足的扩展机会。通过将Echo-Liquid Handler的低容量声学传输能力与库准备工具包相结合,研究人员可以大幅增加生成的库的数量。

回声声学乐动游戏客户端液体处理技术提供了额外的好处。可靠的传输容量低至25纳升的能力允许直接稀释库池,因此没有样品损失或错误传播和池时间显著减少。它也允许小样本量的有效使用。和无端液体处理消除交叉污染,更准确的物种鉴定。使用Echo Liquid Handler,您可以缩小16s rRNA测序和全基因组霰弹枪测序,降低成本和周转时间为您的宏基因组研究。

特色出版

高通量小型化16S rRNA扩增文库的制备降低了成本,同时保留了微生物组的完整性

美国微生物学会

2018年11月/12月

耶利米j . Minichet al。

加州大学圣地亚哥分校斯克里普斯海洋学研究所海洋生物研究组

摘要

下一代测序技术使生物学领域取得了许多进展,微生物生态学主要受益于扩大的样本量。虽然运行测序仪器的成本随着时间的推移已大幅下降,但文库制备方法的价格基本保持不变。在本研究中,我们开发了一种低成本的小型化(5-µl体积)高通量(384样本)扩增文库制备方法。我们的方法将文库准备成本降低到每个样本1.42美元,与现有的自动化方法相比降低了58%,与商业试剂盒相比降低了21倍,同时没有影响测序成功或扭曲微生物群落组成分析。我们进一步验证了优化的方法,在拉霍亚的斯克里普斯海洋研究所码头,通过7个月的16次采样事件,从46条太平洋鲭鱼的5个身体部位取样,用微型化的5µl反应体积(含0.2µl基因组DNA)和标准的25µl反应体积(含1µl基因组DNA)处理鱼微生物组样品。两种方法之间的alpha多样性高度相关(R2 > 0.95),而技术重复距离远低于体位点内变异(P < 0.0001),进一步验证了该方法的有效性。实现小型化文库制备(从三次25µl反应到三次5µl反应)所节省的成本足以覆盖768个样品的MiSeq测序,同时保留准确的微生物组测量值。

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